National Center for Biotechnology Information (NCBI) menyediakan situs web yang komprehensif bagi ahli biologi, yang mencakup biologi yang berhubungan dengan database, dan alat untuk melihat dan menganalisis data yang melekat di database.Sebuah divisi dari Perpustakaan Nasional Kedokteran di National Institutes of Health. NCBI adalah instansi yang bertanggung jawab untuk menciptakan sistem otomatis untuk menyimpan dan menganalisis profesi yang berkembang pesat data genetik dan molekuler. Salah satu tantangan yang paling sulit yang dihadapi dalam bidang bioinformatika adalah bagaimana untuk menyimpan, dengan cara yang mudah diakses, kelimpahan besar informasi baru, termasuk urutan genom keseluruhan, penemuan gen baru yang sedang berlangsung dan produk gen, dan penentuan fungsi dan struktur. NCBI didirikan sebagai respon pemerintah terhadap kebutuhan untuk informasi lebih lanjut dan lebih baik metode pengolahan untuk menangani tantangan ini.
NCBI adalah sebuah gambaran relatif baik dari alat-alat dan database yang dapat diakses melalui NCBI disediakan dalam daftar sepanjang perbatasan kiri halaman rumah. Mengklik pada link berjudul "Tentang NCBI" menghasilkan menu kedua berisi topik "A Primer Ilmu", dan "Database dan Tools", antara lain. Klik pada "A Primer Ilmu" untuk mengakses definisi umum dan informasi pengantar mengenai cabang-cabang ilmu pengetahuan termasuk dalam bioinformatika. Banyak istilah bioinformatika didefinisikan dalam bagian ini secara jelas dan dasar, membuat ini bersifat Primer yaitu sumber pertama yang sangat baik. Dari tabel di bagian atas halaman web, klik pada "Database dan Tools" untuk menghasilkan daftar informasi yang dapat diakses. Ini halaman web yang berisi database dan menu alat adalah pilihan yang baik bagi mereka yang cenderung ke arah bookmark.
Item pertama di bawah menu "Database dan Tools" adalah "Database Sastra". PubMed adalah yang paling banyak digunakan dari database literatur dan dapat digunakan untuk mengakses MEDLINE biologis dan medis jurnal ilmiah kutipan dating kembali ke artikel yang ditulis pada pertengahan 1960-an. Item kedua di bawah menu "Database dan Tools" adalah "Entrez Database". Entrez adalah pencarian dan sistem pengambilan dikembangkan oleh NCBI yang mampu mengakses informasi yang terintegrasi dengan mencari banyak database NCBI dengan hanya satu query (bukan hanya satu database pencarian per query, maka harus mengulangi query untuk menemukan informasi pada topik yang sama dari database lain NCBI). Database NCBI yang termasuk dalam pencarian saat Anda memulai sebuah query Entrez yang ditampilkan bila Anda klik link ini.
Lihatlah daftar dan membaca deskripsi untuk database "urutan Protein". Perhatikan database ini memiliki banyak sumber seperti Swiss-Prot, PIR, PRF, PDB, dan GenBank, yang semua database biologis individu dalam hak mereka sendiri, yang berisi berbagai jenis data tentang protein. Para Entrez diakses "database urutan nukleotida" berisi koleksi urutan nukleotida beranotasi tersedia untuk umum, banyak yang cDNA dan urutan mRNA. Evolusi bioinformatika metode pertambangan data telah sebagian besar didorong oleh jumlah luar biasa dari informasi urutan yang dikumpulkan oleh para ilmuwan dalam beberapa tahun terakhir. Baru urutan fungsi yang tidak diketahui dapat dibandingkan dengan urutan baik ditandai gen dan protein.Kemiripan dapat diidentifikasi antara, urutan baru yang tidak dikenal dan urutan baik ditandai, dan digunakan untuk mendalilkan teori tentang fungsi atau struktur.
Lihatlah daftar dan membaca deskripsi untuk database "urutan Protein". Perhatikan database ini memiliki banyak sumber seperti Swiss-Prot, PIR, PRF, PDB, dan GenBank, yang semua database biologis individu dalam hak mereka sendiri, yang berisi berbagai jenis data tentang protein. Para Entrez diakses "database urutan nukleotida" berisi koleksi urutan nukleotida beranotasi tersedia untuk umum, banyak yang cDNA dan urutan mRNA. Evolusi bioinformatika metode pertambangan data telah sebagian besar didorong oleh jumlah luar biasa dari informasi urutan yang dikumpulkan oleh para ilmuwan dalam beberapa tahun terakhir. Baru urutan fungsi yang tidak diketahui dapat dibandingkan dengan urutan baik ditandai gen dan protein.Kemiripan dapat diidentifikasi antara, urutan baru yang tidak dikenal dan urutan baik ditandai, dan digunakan untuk mendalilkan teori tentang fungsi atau struktur.
Klik pada "Database dan Tools" dari table di bagian atas halaman web. Memilih "Tools untuk Data Mining" topik akan menampilkan daftar alat pengambilan data, termasuk Entrez, yang disebutkan di atas, dan BLAST, yang Alignment Dasar Perangkat Pencarian Lokal. Ledakan adalah jajaran urutan alat utama untuk melakukan pencarian cepat database sekuens nukleotida dan protein dan mendeteksi lokal, serta keberpihakan urutan global, antara urutan query dan urutan database.
NCBI yaitu sekilas singkat di beberapa alat yang lebih banyak digunakan dan database yang disajikan oleh NCBI. Sebagai latihan terakhir, luangkan waktu untuk memilih "Outreach dan Education" link dari table. Ada dua link pada halaman ini yang dapat membuktikan membantu setiap saat, " Course and Tutorial" dan " Glossary".Ada tutorial dalam penggunaan Blast, Entrez dan Pubmed, dan yang lainnya. Kembali ke ini sebagai diperlukan sambil belajar penggunaan alat ini. Para Glosari sangat berguna karena bioinformatika memiliki banyak lapangan khusus istilah dan singkatan yang dapat relatif membingungkan untuk menguraikan.
Tidak ada komentar:
Posting Komentar